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EGFR及基因检测基础知识

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108292 155 草船借箭 发表于 2013-12-16 09:11:44 |
你的紫藤花  高中一年级 发表于 2013-12-21 16:02:41 | 显示全部楼层
草船借箭 发表于 2013-12-21 14:20
我看了你家的治疗帖子,从你家的检查报告看,EGFR没有突变。但是实际情况却是凯美纳服用了挺长时间,而且 ...

谢谢版主!

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期待春天  高中二年级 发表于 2013-12-22 16:58:49 | 显示全部楼层
楼主辛苦,让我们长见识了,谢谢了

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湘湘2012  高中三年级 发表于 2013-12-22 23:33:16 | 显示全部楼层
真是好东西,谢谢楼主扫盲了。

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我心如水1995  小学六年级 发表于 2013-12-23 07:23:12 | 显示全部楼层
学习了,谢谢

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老马  退休老干部 发表于 2013-12-25 08:13:20 | 显示全部楼层
采用灵敏度不同的两种方法检测含有不同比例肿瘤细胞的肺腺癌样本中EGFR的突变状态
Detection of EGFR Mutation Status in Lung Adenocarcinoma Specimens with Different Proportions of Tumor Cells Using Two Methods of Differential Sensitivity
中文摘要:
      引言:本文旨在通过灵敏度不同的两种方法,检测含有不同比例肿瘤细胞的肺腺癌样本中的表皮生长因子受体(EGFR)的突变状态。 方法:通过肽核酸(PNA)钳制法和直接测序法测定EGFR的突变状态。样本包括41个含有不同比例肿瘤细胞的恶性胸腔积液细胞块,以及23例含有20%以上肿瘤细胞的肺活检标本和相应的经手术切除的肿瘤。 结果:在恶性胸腔积液的分析中,9例对EGFR酪氨酸激酶抑制剂显示部分缓解的患者中仅有4例通过PNA钳制法检测出EGFR突变;这4例患者的全部细胞块中含有的肿瘤细胞均少于20%。对EGFR酪氨酸激酶抑制剂有效的5例疾病进展的患者中,有1例通过直接测序法显示为野生型EGFR,但PNA钳制法显示为突变型EGFR;该患者的细胞块中含有高比例的肿瘤细胞。比较含有大量肿瘤细胞的活检样本和相应手术切除的肿瘤显示,4例采用PNA钳制法检测的患者的EGFR突变状态不一致,但直接测序法未见有差异。 结论:高灵敏度方法,如PNA钳制法,对于检测含有肿瘤细胞较低的诊断样本的EGFR突变状态可能优于直接测序法。当诊断样本肿瘤细胞比例较高时,直接测序法可能更具代表性。
英文摘要:
      Introduction: To evaluate epidermal growth factor receptor (EGFR) mutation status in lung adenocarcinoma specimens with different proportions of tumor cells using two methods with different sensitivities. Methods: EGFR mutation status was determined by peptide nucleic acid (PNA) clamping and direct sequencing. The samples consisted of 41 cell blocks of malignant pleural effusions with various proportions of tumor cells, as well as 23 lung biopsy specimens containing more than 20% tumor cells and the corresponding surgically resected tumors. Results: In the analysis of malignant pleural effusions, EGFR mutations were detected only by PNA clamping in four of nine patients who exhibited partial response to EGFR tyrosine kinase inhibitors; all the cell blocks of these four patients contained less than 20% tumor cells. Direct sequencing revealed wild-type EGFR, whereas PNA clamping revealed mutant EGFR, in one of five patients who exhibited progressive disease in response to EGFR tyrosine kinase inhibitor; the cell block of this patient contained a high proportion of tumor cells. A comparison of biopsy specimens containing sufficient tumor cells and the corresponding surgically resected tumors revealed discordance in the EGFR mutation status in four patients based on PNA clamping, whereas no discrepancies were observed by direct sequencing. Conclusions: Highly sensitive methods, such as PNA clamping, may be superior to direct sequencing for the detection of EGFR mutations in diagnostic specimens with a low proportion of tumor cells. Direct sequencing may be more representative when diagnostic specimens with a high proportion of tumor cells are available.

点评

"对EGFR酪氨酸激酶抑制剂有效的5例疾病进展的患者中",应该是:5例对EGFR酪氨酸激酶抑制剂有疾病进展的患者中  发表于 2014-6-16 18:13
个人公众号:treeofhope

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老马  退休老干部 发表于 2013-12-25 08:15:13 | 显示全部楼层
PCR.JPG

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河东河西  初中二年级 发表于 2013-12-25 22:52:51 | 显示全部楼层
学习,拿分,闪人。

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Ryan  初中三年级 发表于 2013-12-25 23:44:07 | 显示全部楼层
见过最详细的,学习了,谢了。

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爱笑的天使  初中一年级 发表于 2013-12-26 10:31:43 | 显示全部楼层
学习了,谢谢楼主!
医生也说过由于取样的关系,基因检测不一定准确,不过如果ALK检测阳性是不是可以断定EGFR/KRAS一定是野生的呢?两者是否不能共存?

点评

ALK与EGFR共同突变,罕见,但是存在。如果是ALK阳性,那么基本不可能是EGFR突变。  发表于 2013-12-26 10:41

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爱笑的天使  初中一年级 发表于 2013-12-26 11:02:00 | 显示全部楼层
爱笑的天使 发表于 2013-12-26 10:31
学习了,谢谢楼主!
医生也说过由于取样的关系,基因检测不一定准确,不过如果ALK检测阳性是不是可以断定E ...

那请问化疗对基因的影响大吗?比如六次化疗后原本野生型的会变成突变型吗?或者是说,原本就是突变型没被检测出来?
谢谢楼主!

点评

我有个朋友在纽约的肿瘤研究中心,他跟我说化疗不影响突变的基因。  发表于 2014-2-12 20:53
化疗有可能会使基因突变发生变化。  发表于 2013-12-26 11:14

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